ที่ เครื่องดูดฝุ่นตั้งพื้น ระบบการกรองของเป็นแนวป้องกันที่สำคัญเพื่อให้แน่ใจว่าอากาศภายในอาคารจะบริสุทธิ์ บรรลุเป้าหมายนี้ผ่านกระบวนการกรองที่หลากหลายและวิธีการทางเทคนิคขั้นสูง
ประการแรก การกรองหลักมักจะดำเนินการโดยตัวกรองที่มีรูพรุนขนาดใหญ่ ตัวกรองนี้มีหน้าที่หลักในการดักจับอนุภาคขนาดใหญ่ของฝุ่น ผม เศษซาก และสารอื่นๆ เมื่อเครื่องดูดฝุ่นเริ่มทำงาน อากาศจะถูกดูดไปด้วยมลภาวะต่างๆ ตัวกรองหลักเป็นเหมือนสิ่งกีดขวางแรก โดยปิดกั้นอนุภาคขนาดใหญ่ที่มองเห็นได้ของสิ่งสกปรก ตัวอย่างเช่น เมื่อทำความสะอาดพื้นห้องนั่งเล่น อนุภาคขนาดใหญ่ของขยะ เช่น ขนสัตว์เลี้ยงและเศษอาหาร จะถูกดักจับโดยตัวกรองหลักก่อน เพื่อป้องกันไม่ให้เข้าสู่กระบวนการกรองที่ตามมา ลดภาระในส่วนประกอบการกรองที่ตามมา และยังหลีกเลี่ยง อนุภาคขนาดใหญ่จากการทำลายชิ้นส่วนอื่นๆ ภายในเครื่องดูดฝุ่น
การกรองระดับกลางมักใช้ตัวกรอง HEPA (ตัวกรองอากาศประสิทธิภาพสูง) แผ่นกรอง HEPA สามารถกรองอนุภาคขนาดเล็ก เช่น ละอองเกสรดอกไม้ มูลไรฝุ่น แบคทีเรีย ไวรัส ฯลฯ หลักการกรองคือผ่านโครงสร้างเส้นใยละเอียด อนุภาคขนาดเล็กเหล่านี้จะถูกดูดซับหรือสกัดกั้นโดยเส้นใยเมื่ออากาศผ่านไป ประสิทธิภาพการกรองของแผ่นกรอง HEPA สูงมาก สำหรับอนุภาคที่มีขนาดใหญ่กว่า 0.3 ไมครอน ประสิทธิภาพการกรองสามารถเข้าถึงได้มากกว่า 99.97% ในสภาพแวดล้อมในห้องนอน ผู้ที่แพ้ละอองเกสรดอกไม้สามารถใช้แผ่นกรอง HEPA ของเครื่องดูดฝุ่นเพื่อกำจัดละอองเกสรดอกไม้ในอากาศได้อย่างมีประสิทธิภาพ และลดการเกิดอาการแพ้ ในบ้านที่มีสัตว์เลี้ยงและไรฝุ่น แผ่นกรอง HEPA ของเครื่องดูดฝุ่นสามารถดูดซับมลพิษเล็กๆ เช่น มูลของไรฝุ่น ฟอกอากาศภายในอาคาร และลดภัยคุกคามต่อสุขภาพของมนุษย์
เครื่องดูดฝุ่นตั้งพื้นระดับไฮเอนด์บางรุ่นมีตัวกรองถ่านกัมมันต์ติดตั้งด้วย ถ่านกัมมันต์มีความสามารถในการดูดซับสูงและสามารถกำจัดกลิ่น ก๊าซที่เป็นอันตราย ฯลฯ ในอากาศได้ เมื่ออากาศผ่านตัวกรองถ่านกัมมันต์ สารประกอบอินทรีย์ระเหยง่าย เช่น ฟอร์มาลดีไฮด์ เบนซิน สาร TVOC และกลิ่นต่างๆ เช่น กลิ่นสัตว์เลี้ยง และกลิ่นควันในครัว จะถูกดูดซับโดยถ่านกัมมันต์ ตัวอย่างเช่น ในห้องที่ได้รับการปรับปรุงใหม่ แผ่นกรองถ่านกัมมันต์ของเครื่องดูดฝุ่นตั้งพื้นสามารถดูดซับก๊าซที่เป็นอันตราย เช่น ฟอร์มาลดีไฮด์ ในระหว่างกระบวนการทำความสะอาด เร่งกระบวนการฟอกอากาศภายในอาคาร ทำให้อากาศภายในอาคารสดชื่นและน่าพึงพอใจยิ่งขึ้น และสร้าง สภาพแวดล้อมภายในอาคารที่ดีต่อสุขภาพและสะดวกสบายสำหรับผู้พักอาศัย
นอกจากนี้ เครื่องดูดฝุ่นตั้งพื้นขั้นสูงบางรุ่นใช้เทคโนโลยีการแยกแบบไซโคลนร่วมกับระบบการกรอง เทคโนโลยีการแยกไซโคลนใช้กระแสลมหมุนความเร็วสูงเพื่อสร้างแรงเหวี่ยงเพื่อแยกอนุภาคขนาดใหญ่และหนักกว่าออกจากอากาศแล้วโยนลงในถังเก็บฝุ่น ซึ่งช่วยลดแรงกดดันต่อระบบการกรองอีกทั้งยังปรับปรุงประสิทธิภาพการกรองและผลการฟอกอากาศอีกด้วย ในขณะเดียวกัน ระบบการกรองของเครื่องดูดฝุ่นก็เน้นไปที่ประสิทธิภาพการปิดผนึกในการออกแบบเพื่อป้องกันไม่ให้อากาศที่ไม่มีการกรองรั่วไหลกลับเข้าไปในห้อง ทำให้มั่นใจได้ว่าเฉพาะอากาศบริสุทธิ์ที่ถูกกรองทีละชั้นเท่านั้นที่จะถูกระบายออกสู่สภาพแวดล้อมภายในอาคาร